为了加快学科发展，2016年医院整合神经内科、神经外科、神经电生理室，成立脑科中心，作为集神经系统疾病筛查、诊治、预防、康复、教学、临床研究为一体的脑系专科诊治中心，被国家卫健委脑卒中防治工程委员会授予的省级“高级卒中中心”。现为“中国帕金森联盟成员单位”、“国家神经系统疾病临床医学研究中心—神经免疫与感染疾病研究分中心”、“首都医科大学附属北京天坛医院神经介入联盟成员单位”、“国家神经系统疾病临床医学研究中心—神经系统疾病专科联盟成员单位”、“国家心脑血管病联盟成员单位”、“国家卫健委推广项目—颅内协助微创清除术临床协助医院”、长江上游神经外科专科联盟副理事长单位、中国意识障碍医生联盟成员单位。

该中心拥有一大批神经内外科、介入科、脑重症医学、脑功能康复、神经影像等多学科组合的专家和专业医疗与护理队伍，主要收治脑卒中、脑血管病、癫痫、痴呆、帕金森病、神经重症、颅脑创伤等各类患者。拥有独立的神经电生理室、脑血管超声检查室、脑脊液细胞学检查室、前庭功能检测室和多导睡眠监测室。配有一系列高精尖设备，如：神经机器人导航系统、德国神经内窥镜、脊柱通道系统、3.0T生命感知磁共振成像系统、GE公司后超高端Revolution螺旋CT、德国西门子全数字化平板减影血管机、神经中央监护分析系统、一体化视频脑电监测工作站等。

神经内科目前开放床位150张，现有医护人员107人，其中硕士研究生导师1人，高级职称10人，博士研究生2人，硕士研究生15人。诊治病种包括脑血管病、中枢神经系统感染性疾病、中枢神经系统脱髓鞘疾病、运动障碍疾病、癫痫、痴呆、头痛、脊髓疾病、周围神经疾病、神经-肌肉接头和肌肉疾病、神经系统变性及遗传病、睡眠障碍等。重视科研及新技术的开展，2015年参与北京天坛医院主持的“急性脑血管病血管内治疗的多中心临床研究”。2016年参与宣武医院主持的“solitaire支架机械取栓治疗中国急性基底动脉闭塞患者的安全性疗效”前瞻性、多中心、随机对照、开放式临床研究。2016年参加天坛医院主持的“急性缺血性卒中血管内治疗关键技术及急救流程改进研究”。2018年参与和长海医院合作临床科研项目“中国急性大血管闭塞性缺血性卒中直接动脉治疗的疗效评估”。2018年成功申报重庆市科委技术创新与应用示范项目2项——《渝东北地区高级卒中中心诊治关键技术的研发及推广》和《卒中中心建设及示范推广》。此外，学科还承担省市级科研项目10项，其中获市级医学科技成果二等奖2项，三等奖2项；承担万州区科研项目17项，获万州区卫生系统科技进步一等奖1项，二等奖8项，三等奖2项。近5年来在国内外学术期刊上发表学术论文近100篇。

神经外科分5个亚专业组：脑血管病专业组、功能神经专业组、垂体瘤神经内镜专业组、脊柱脊髓专业组、高血压脑出血专业组。现有专业技术人员65人，医师组18人、护理组43人、高压氧室6人，其中主任医师2人，副主任医师5人，硕士研究生10人，在读博士3人。开放床位70张，拥有专科NICU及专业的护理团队。常规开展颅脑创伤救治、脑膜瘤、胶质瘤、听神经瘤、垂体瘤、高血压脑出血、颅内动脉瘤、脑血管畸形、烟雾病、颈动脉狭窄、脑积水、脑脓肿、难治性癫痫、三叉神经痛、面肌及咬肌痉挛、帕金森病、原发性震颤、痉挛性斜颈、梅杰综合征、幻肢痛、昏迷病人促醒、神经源性膀胱、神经病理性疼痛、痉挛性脑瘫、椎管肿瘤、脊髓肿瘤、脊柱损伤固定、脊柱矫形等。2015年至2020年，科室引进新技术新项目20项，已有3项获奖，其余新技术尚在开展中。申请国家自然科学基金1项，主持科研课题研究10项，其中国家级科研1项，市级5项，区级1项，获万州区科技进步二等奖2项。在学术期刊上发表SCI论文6篇、CSCD论文5篇。参与出版著作2部。