单细胞测序和空间转录组学是前沿的生命科学技术，有助于推动基因组学科技创新，提高我国在生命科学领域的科研水平和竞争力。基于人工智能的空间转录组学数据分析有利于探究组织的生理状态和疾病机制、识别细胞转录因子和基因调控网络、揭示细胞亚型的异质性和多样性、发现潜在的治疗靶点，为研究疾病诊断、预防和治疗提供重要的基础数据和科学依据。

2023年4月20日，威尼斯电子游戏大厅印明柱团队在Briefings in Bioinformatics在线发表题为“Graph deep learning enabled spatial domains identification for spatial transcriptomics”的空间转录组学方法学文章，提出了一种基于图神经网络和贝叶斯高斯混合模型的自适应空间域识别策略，该策略涵盖双层架构，上层充分利用细胞基因表达谱和空间位置信息生成特征矩阵低维表征，下层进行细胞亚群个数的自适应识别。实验表明，该方法在多个基准空间转录组数据集上相较于主流的聚类方法取得了显著提升。

作者简介：

通信作者  印明柱

威尼斯电子游戏大厅特聘教授、博士生导师，医学病理中心、临床研究中心及肿瘤早期诊治中心主任，临床转化研究中心主任。

2019年入选国家级人才（青年）；2020年兼职受聘美国耶鲁大学医学院病理系助理教授（2020年-至今）；2021年湖南省杰出青年基金获得者；2022年入选工信部“领军人才”。曾先后在美国国立卫生研究院抗衰老研究所（NIH/NIA）遗传系和美国耶鲁大学医学院病理科做博士后及副研究员；回国后曾就职中南大学湘雅医院特聘教授、博士生导师、皮肤科副主任。

现在研1.1类原创新药5项，其中2项获批临床试验（临床试验2期阶段），1项正在IND申报中。现负责研究的项目获国家1.1类新药临床批件2项；参与获省部科技进步二等奖1项，主持科技部重点研发子课题及国自然面上基金项；申请国家发明专利及软著20余项，已授权5项；发表SCI论文80余篇，其中以第一及通讯作者发表SCI论文40余篇；研究成果发表在Nature, Science Translational Medicine, JCI, J Hepatol, Circulation Research, Nature Communication等杂志；获国家重点研发计划子课题1项及主持国家自然科学基金面上项目2项。主要学术兼职：中国食品药品企业质量安全促进会-细胞医药分会副会长、旅美科技协会总会副会长及重庆市联络人；Tumor Discovery杂志创刊主编。该团队全年招收临床及科研PI、全职博士后，有感兴趣的同学欢迎咨询：yinmingzhu2008@126.com

第一作者  刘腾  

博士，威尼斯电子游戏大厅副研究员、硕士生导师；加拿大滑铁卢大学认知自动驾驶实验室博士后研究员

专注人工智能算法的基础理论与应用基础研究。研究方向包括基于人工智能的单细胞测序和空间转录组学数据研究，复杂疾病数据库与计算分析平台构建，无人驾驶/智能网联汽车决策与规划，新能源汽车动力学建模及能量管理策略。基于相关研究成果，发表学术论文70余篇，其中以第一/通讯作者身份在Briefings Bioinf., Nucleic Acids Res., IEEE/ASME T Mech., IEEE Trans. Ind. Electron., IEEE Trans Industr Inform，Appl. Energy, Energy, Renew. Sust. Energ. Rev.等一区TOP期刊上发表SCI论文50余篇，会议论文17篇。目前Google Scholar总引用次数4700余次, H-index 34, 他引超过4000次，ESI高被引论文6篇。参与编写和翻译专著5部，授权专利2项，获软件著作权5项。近5 年作为技术负责人、科研骨干，主持和参与了重点实验室开放基金、国家自然科学基金、国防基础科研重点项目、美国能源基金会项目、国家863计划、中国-瑞士国际合作项目等十余项课题的研究。